安徽医科大学临床医学院是2003年经国家教育部和安徽省人民政府批准，由安徽医科大学创建的独立学院；2017年遵照教育部26号令要求，由安徽医科大学与安徽新华集团投资有限公司合作举办，是按新机制和新模式运行的普通本科高校。
安徽医科大学临床医学院先后建立了临床医学系、护理系、医学技术系、药学与生物医学工程系、公共卫生与卫生管理系、基础医学部、马克思主义学院、公共课程部与实验教学中心。现设有临床医学、护理学、药学、生物医学工程、公共事业管理、眼视光学、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗学、健康服务与管理、预防医学、智能医学工程、生物医药数据科学、生物制药等15个本科专业，其中护理学与临床医学先后获批为省级一流专业。学生完成规定课程和实习内容，经考核合格准予毕业，发放由教育部注册的安徽医科大学临床医学院毕业证书，符合学位授予条件者可授予安徽医科大学临床医学院相关学科的学士学位。