黑龙江农业经济职业学院始建于1958年，前身为东北农学院牡丹江分院（本科建制），1962年调整为中专，2002年晋升为高职院校。2019年隶属关系由黑龙江省农业农村厅转为黑龙江省教育厅。学院坚守乡村办学65载，始终坚持“立足乡村办学、倾心于农业职业教育、零距离服务‘三农’”的办学宗旨，坚持“不更名不去农、不搬迁不进城”，与周边农业市（县）建立了紧密的产学研合作关系，积淀形成了“学校在农村、课堂在田间、教研在基地、成果进农家”的办学特色。
黑龙江农业经济职业学院占地126.5万平方米，建筑面积24.5万平方米，固定资产5.36亿元，教学仪器设备总值2.49亿元。学院现有教职工535人，专任教师399人。拥有全国高校黄大年式教师团队1个、国家级职业教育教师教学创新团队2个、国家级优秀教学团队1个、国家级课程思政改革示范团队3个、全国高校党建工作样板支部１个、国家级“双师型”教师培训基地1个、省级团队17个，入选农业农村部“名师名课”项目1人、享受黑龙江省政府特殊津贴3人、省级名师（优秀教师、思政名师等）20人，省级高层次人才7人。教师获国家级教学成果奖5项、省级教学成果奖35项。
黑龙江农业经济职业学院设有7个系部，紧密对接农业生产、加工、流通、销售产业链建设了现代农业、现代畜牧、绿色食品、农业经济贸易、农业信息化五大涉农专业群，入选国家高水平专业群1个、省级高水平专业群3个。开设高职专业45个，现有全日制在校学生10895人。获批国家级重点（骨干）专业10个、国家级教改试点专业1个、国家现代学徒制试点专业２个，省级重点建设专业8个、省级教改试点专业1个。