白城医学高等专科学校建于1958年，当时隶属省卫生厅。1962年下放地方并调整为中专。1985年以来先后与原白求恩医科大学等三所高校开展联合办学。1998、1999年先后晋升为省部级重点校、国家级重点示范校。2001年与吉林大学共建吉林大学白城医学院，2002年白城粮食学校并入，2004年经教育部批准恢复专科学校。同年6月，原白城铁路医院划归学校作为附属医院。2011年12月经省政府批准上划省管，成为吉林西部、大兴安岭南麓片区唯一一所省属医学类高等专科学校。
白城医学高等专科学校设有护理学院、口腔医学院、医学技术学院、临床医学院、药学院、康复医学院、中医学院、眼视光学院、医学美容学院、基础医学院、公共教育学院、马克思主义学院、信息化学院、继续教育学院共14个学院。开设临床医学、预防医学、口腔医学、中医学、针灸推拿、护理、助产、药学、中药学、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗技术、眼视光技术、医学美容技术等27个专业。