牡丹江医学院是黑龙江省东南部地区唯一一所省属普通本科医药院校，坐落于黑龙江省东南部重要的中心城市和风景旅游城市——牡丹江市。学校历史溯源于1946年始建的牡丹江专区医院和1956年始建的黑龙江省卫生干部进修学校，1958年创建牡丹江医学院，著名历史学家郭沫若先生题写了校名。
牡丹江医学院历届毕业证样本
1958年，牡丹江医学院创立。
1962年，牡丹江医学院改为牡丹江卫生学校。
1978年，牡丹江卫生学校更名为牡丹江医学专科学校。
1986年，牡丹江医学专科学校更名为牡丹江医学院。
1997年，学校一次性通过中国原国家教委合格评估。
2006年，学校在中国国家本科教学水平评估中被专家组给予了优秀的评价。
2009年，学校经中国国务院学位委员会批准为新增硕士学位立项建设单位。
2010年，被列为黑龙江省特色应用型本科高校建设单位。
2012年，被评为中国全国首批卓越医生教育培训计划项目试点高校。
2013年，学校获得硕士学位授予权。
2015年，学校在中国教育部临床医学专业认证中获得了6年有效期。
2018年2月，学校入选黑龙江省高水平大学和优势特色学科建设高校及建设学科。
2023年6月15日，黑龙江省教育厅发布公示，拟同意牡丹江医学院更名为牡丹江医科大学
牡丹江医学院历任校院长
阴兆峰1988年5月-1991年10月任牡丹江医学院院长
系纯厚1991年10月-1998年5月任牡丹江医学院院长
胡怀明1998年5月-2003年6月任牡丹江医学院院长
金秀东2003年6月-2010年12月任牡丹江医学院院长
冯克俭2010年12月-2014年4月任牡丹江医学院院长
关利新2014年4月-2016年4月任牡丹江医学院院长