新疆农业大学科学技术学院（College of Science and Technology Xinjiang Agricultural University）是本科层次独立学院。已于2020年终止办学，并入新疆农业大学。
学校由2002年7月经自治区教育厅批准成立，2004年经国家教育部重新审批确认，为全国首批确认的124所（其中新疆2所）独立学院之一，是实施本科层次普通高等教育的独立学院。
学院有农大东路校区（乌鲁木齐市沙区农大东路110号，占地84亩）和西山校区（乌鲁木齐市沙区西山新镇聚安路888号）。
2020年10月25日，新疆维吾尔自治区教育厅发布公告称，新疆农业大学科学技术学院终止办学，原学校并入新疆农业大学。
学校总占地534亩，分农大、西山两个校区，其中农大校区位于乌鲁木齐市农大东路110号，校园占地84亩。西山校区占地450亩（规划占地1560亩），坐落于西山大学城，距离乌鲁木齐市中心25公里，地处亚心腹地，于2014年启动建设，总体规划面积1560亩，总建筑面积48万平方米；一期校园面积450亩，一期一步建筑面积10万平方米。已于2017年9月投入使用，可满足15000人办学规模需要。